MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium sp. JDM601 chromosome

Total Repeats: 126817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015576	TAC	2	6	110119	110124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988750
3002	NC_015576	GCT	2	6	110133	110138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988750
3003	NC_015576	GAT	2	6	110217	110222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988750
3004	NC_015576	GTT	2	6	110241	110246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988750
3005	NC_015576	ACC	2	6	110260	110265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988750
3006	NC_015576	CAT	2	6	110295	110300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988750
3007	NC_015576	CGG	2	6	110355	110360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988750
3008	NC_015576	GCC	2	6	110413	110418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988750
3009	NC_015576	CAT	2	6	110430	110435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988750
3010	NC_015576	CCCGC	2	10	110440	110449	0 %	0 %	20 %	80 %	333988750
3011	NC_015576	CGACG	2	10	110487	110496	20 %	0 %	40 %	40 %	333988750
3012	NC_015576	GCC	2	6	110531	110536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988750
3013	NC_015576	GAC	2	6	110539	110544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988750
3014	NC_015576	GTTC	2	8	110609	110616	0 %	50 %	25 %	25 %	333988750
3015	NC_015576	ACC	3	9	110617	110625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988750
3016	NC_015576	ACT	2	6	110648	110653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988750
3017	NC_015576	GCA	2	6	110685	110690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988750
3018	NC_015576	GGA	2	6	110769	110774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988750
3019	NC_015576	GCC	2	6	110793	110798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988750
3020	NC_015576	TGC	2	6	110905	110910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988751
3021	NC_015576	CAC	2	6	110916	110921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988751
3022	NC_015576	TAC	2	6	110928	110933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988751
3023	NC_015576	CGA	2	6	110969	110974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988751
3024	NC_015576	TCG	2	6	111010	111015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988751
3025	NC_015576	CAGC	2	8	111037	111044	25 %	0 %	25 %	50 %	333988751
3026	NC_015576	GCACA	2	10	111051	111060	40 %	0 %	20 %	40 %	333988751
3027	NC_015576	CCG	2	6	111081	111086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988751
3028	NC_015576	ACG	2	6	111130	111135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988751
3029	NC_015576	CCG	2	6	111140	111145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988751
3030	NC_015576	CGA	2	6	111224	111229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988751
3031	NC_015576	GCT	2	6	111230	111235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988751
3032	NC_015576	GACCT	2	10	111252	111261	20 %	20 %	20 %	40 %	333988751
3033	NC_015576	CGG	2	6	111269	111274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988751
3034	NC_015576	GTG	2	6	111279	111284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988751
3035	NC_015576	GCT	2	6	111302	111307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988751
3036	NC_015576	CGG	2	6	111343	111348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988751
3037	NC_015576	GCGG	2	8	111462	111469	0 %	0 %	75 %	25 %	333988751
3038	NC_015576	TCG	2	6	111478	111483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988751
3039	NC_015576	GC	3	6	111515	111520	0 %	0 %	50 %	50 %	333988751
3040	NC_015576	GAC	2	6	111525	111530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988751
3041	NC_015576	GCG	2	6	111537	111542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988751
3042	NC_015576	CTG	2	6	111549	111554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988751
3043	NC_015576	CGG	2	6	111566	111571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988751
3044	NC_015576	TCG	2	6	111592	111597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988751
3045	NC_015576	CCG	2	6	111620	111625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988751
3046	NC_015576	CGC	2	6	111638	111643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988751
3047	NC_015576	GC	3	6	111647	111652	0 %	0 %	50 %	50 %	333988751
3048	NC_015576	CGG	3	9	111658	111666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988751
3049	NC_015576	GAG	2	6	111681	111686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988751
3050	NC_015576	GC	3	6	111700	111705	0 %	0 %	50 %	50 %	333988751
3051	NC_015576	ACC	2	6	111756	111761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988751
3052	NC_015576	CAT	2	6	111779	111784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988751
3053	NC_015576	GCT	2	6	111788	111793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988751
3054	NC_015576	CGA	2	6	111809	111814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988751
3055	NC_015576	CGA	2	6	111833	111838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988751
3056	NC_015576	CGCT	2	8	111864	111871	0 %	25 %	25 %	50 %	333988751
3057	NC_015576	ACC	2	6	111907	111912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988751
3058	NC_015576	TCG	2	6	111976	111981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988751
3059	NC_015576	TGC	2	6	112141	112146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988752
3060	NC_015576	TCG	2	6	112153	112158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988752
3061	NC_015576	CCG	2	6	112159	112164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988752
3062	NC_015576	GC	3	6	112198	112203	0 %	0 %	50 %	50 %	333988752
3063	NC_015576	GCG	2	6	112225	112230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988752
3064	NC_015576	GCG	2	6	112236	112241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988752
3065	NC_015576	GAA	2	6	112244	112249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988752
3066	NC_015576	TCG	2	6	112270	112275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988752
3067	NC_015576	GTC	2	6	112323	112328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988752
3068	NC_015576	GCCG	2	8	112412	112419	0 %	0 %	50 %	50 %	333988752
3069	NC_015576	GCGT	2	8	112443	112450	0 %	25 %	50 %	25 %	333988752
3070	NC_015576	GCGCA	2	10	112473	112482	20 %	0 %	40 %	40 %	333988752
3071	NC_015576	GGCC	2	8	112490	112497	0 %	0 %	50 %	50 %	333988752
3072	NC_015576	CTG	2	6	112533	112538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988752
3073	NC_015576	GGC	2	6	112556	112561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988752
3074	NC_015576	CGG	2	6	112569	112574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988752
3075	NC_015576	CGC	2	6	112610	112615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988752
3076	NC_015576	CCG	2	6	112633	112638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988752
3077	NC_015576	CCA	2	6	112645	112650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988752
3078	NC_015576	CCGG	2	8	112685	112692	0 %	0 %	50 %	50 %	333988752
3079	NC_015576	CCA	2	6	112715	112720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988752
3080	NC_015576	CGG	2	6	112760	112765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988752
3081	NC_015576	GAC	3	9	112791	112799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988752
3082	NC_015576	TGC	2	6	112825	112830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988752
3083	NC_015576	CAA	2	6	112832	112837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988752
3084	NC_015576	CG	3	6	112861	112866	0 %	0 %	50 %	50 %	333988752
3085	NC_015576	GCT	2	6	112919	112924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988752
3086	NC_015576	GAA	2	6	112925	112930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988752
3087	NC_015576	GCC	2	6	112968	112973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988752
3088	NC_015576	CCGG	2	8	112988	112995	0 %	0 %	50 %	50 %	333988752
3089	NC_015576	TCG	2	6	113020	113025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988752
3090	NC_015576	ACC	2	6	113055	113060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988753
3091	NC_015576	GGC	2	6	113075	113080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988753
3092	NC_015576	GGA	2	6	113110	113115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988753
3093	NC_015576	CGGG	2	8	113123	113130	0 %	0 %	75 %	25 %	333988753
3094	NC_015576	GAT	2	6	113171	113176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988753
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3098	NC_015576	GAT	2	6	113305	113310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988753
3099	NC_015576	CCG	2	6	113316	113321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988753
3100	NC_015576	GGC	3	9	113326	113334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988753
3101	NC_015576	ACCG	2	8	113359	113366	25 %	0 %	25 %	50 %	333988753
3102	NC_015576	GAT	2	6	113446	113451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988753
3103	NC_015576	CCG	3	9	113457	113465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988753
3104	NC_015576	CCG	2	6	113526	113531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988753
3105	NC_015576	CCA	2	6	113568	113573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988753
3106	NC_015576	GCC	2	6	113624	113629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988753
3107	NC_015576	CGC	2	6	113638	113643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988753
3108	NC_015576	CGG	2	6	113650	113655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988753
3109	NC_015576	GAT	2	6	113698	113703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988753
3110	NC_015576	TGA	2	6	113777	113782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988753
3111	NC_015576	GCC	2	6	113812	113817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988754
3112	NC_015576	GC	3	6	113850	113855	0 %	0 %	50 %	50 %	333988754
3113	NC_015576	TCGCCG	2	12	113864	113875	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333988754
3114	NC_015576	GGT	2	6	113907	113912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988754
3115	NC_015576	ACG	2	6	113927	113932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988754
3116	NC_015576	ACC	2	6	113992	113997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988754
3117	NC_015576	CAA	2	6	114030	114035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988754
3118	NC_015576	GCG	2	6	114055	114060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988754
3119	NC_015576	CGA	2	6	114066	114071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988754
3120	NC_015576	GGC	2	6	114135	114140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988754
3121	NC_015576	AGC	2	6	114146	114151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988754
3122	NC_015576	GCC	2	6	114169	114174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988754
3123	NC_015576	GTG	2	6	114175	114180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988754
3124	NC_015576	GCA	2	6	114188	114193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988754
3125	NC_015576	GCC	2	6	114274	114279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988754
3126	NC_015576	ACC	2	6	114352	114357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988754
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3128	NC_015576	CGT	2	6	114449	114454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988754
3129	NC_015576	TCA	2	6	114455	114460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988754
3130	NC_015576	GTG	2	6	114475	114480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988754
3131	NC_015576	CGG	2	6	114483	114488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988754
3132	NC_015576	GTCG	2	8	114527	114534	0 %	25 %	50 %	25 %	333988755
3133	NC_015576	CAT	2	6	114536	114541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988755
3134	NC_015576	CGG	2	6	114554	114559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988755
3135	NC_015576	CTG	2	6	114576	114581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988755
3136	NC_015576	CGG	2	6	114582	114587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988755
3137	NC_015576	CGG	2	6	114632	114637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988755
3138	NC_015576	GCCTG	2	10	114664	114673	0 %	20 %	40 %	40 %	333988755
3139	NC_015576	TACTCC	2	12	114693	114704	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333988755
3140	NC_015576	GCC	2	6	114777	114782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988755
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3143	NC_015576	CGG	2	6	114910	114915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988755
3144	NC_015576	TGC	2	6	114937	114942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988755
3145	NC_015576	AGC	2	6	114958	114963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988755
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3147	NC_015576	CGC	2	6	115088	115093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988755
3148	NC_015576	CACCGC	2	12	115283	115294	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	333988755
3149	NC_015576	GCG	2	6	115295	115300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988755
3150	NC_015576	TCT	2	6	115381	115386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333988755
3151	NC_015576	GGCC	2	8	115410	115417	0 %	0 %	50 %	50 %	333988755
3152	NC_015576	GGT	2	6	115427	115432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988755
3153	NC_015576	GTG	2	6	115503	115508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988755
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3157	NC_015576	CTT	2	6	115646	115651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333988755
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3169	NC_015576	TGA	2	6	115983	115988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988755
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3172	NC_015576	GAC	2	6	116057	116062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988756
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3186	NC_015576	CGC	3	9	116529	116537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988756
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3193	NC_015576	GGT	3	9	116652	116660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988756
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3212	NC_015576	CGA	2	6	117434	117439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988757
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3215	NC_015576	CGG	2	6	117595	117600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3232	NC_015576	CGT	3	9	118107	118115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3233	NC_015576	CAA	2	6	118145	118150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988759
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3237	NC_015576	TGA	2	6	118346	118351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988759
3238	NC_015576	TCG	2	6	118376	118381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988759
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3240	NC_015576	GGT	2	6	118515	118520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988759
3241	NC_015576	CTG	2	6	118546	118551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988759
3242	NC_015576	GTG	3	9	118558	118566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988759
3243	NC_015576	ACC	2	6	118696	118701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988759
3244	NC_015576	ACGA	2	8	118783	118790	50 %	0 %	25 %	25 %	333988759
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3246	NC_015576	CTG	2	6	118840	118845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988759
3247	NC_015576	GCC	2	6	118924	118929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988759
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3255	NC_015576	GTC	2	6	119212	119217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988759
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3259	NC_015576	GGT	2	6	119388	119393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988759
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3261	NC_015576	ATC	2	6	119413	119418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988759
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3264	NC_015576	CGC	2	6	119541	119546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988759
3265	NC_015576	CTG	3	9	119563	119571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988759
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3267	NC_015576	TCG	2	6	119636	119641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988759
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3270	NC_015576	GGC	2	6	119770	119775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3271	NC_015576	TCA	2	6	119836	119841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3272	NC_015576	GA	3	6	119899	119904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3273	NC_015576	GA	3	6	119918	119923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3274	NC_015576	TGC	2	6	119944	119949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3312	NC_015576	CGC	2	6	121123	121128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988761
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3324	NC_015576	CGAT	2	8	121562	121569	25 %	25 %	25 %	25 %	333988761
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3332	NC_015576	TCA	2	6	121784	121789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988762
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3352	NC_015576	GCT	2	6	122415	122420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988762
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3355	NC_015576	GCT	2	6	122517	122522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988762
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3479	NC_015576	GAC	2	6	127687	127692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988766
3480	NC_015576	CACG	2	8	127695	127702	25 %	0 %	25 %	50 %	333988766
3481	NC_015576	CCA	2	6	127712	127717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988766
3482	NC_015576	GCT	2	6	127722	127727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988766
3483	NC_015576	ACG	2	6	127748	127753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988766
3484	NC_015576	CGC	2	6	127781	127786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988766
3485	NC_015576	CAG	2	6	127807	127812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988766
3486	NC_015576	TCA	2	6	127820	127825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988766
3487	NC_015576	CAA	2	6	127896	127901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988766
3488	NC_015576	CG	3	6	127926	127931	0 %	0 %	50 %	50 %	333988766
3489	NC_015576	CTG	2	6	127966	127971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988766
3490	NC_015576	TCA	2	6	128033	128038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988766
3491	NC_015576	CTC	2	6	128040	128045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333988766
3492	NC_015576	TCGA	2	8	128071	128078	25 %	25 %	25 %	25 %	333988766
3493	NC_015576	TGC	2	6	128114	128119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988766
3494	NC_015576	GC	4	8	128118	128125	0 %	0 %	50 %	50 %	333988766
3495	NC_015576	GAT	2	6	128157	128162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988766
3496	NC_015576	CGG	2	6	128202	128207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988766
3497	NC_015576	TGA	2	6	128263	128268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988767
3498	NC_015576	CGC	2	6	128288	128293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988767
3499	NC_015576	TAC	2	6	128313	128318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988767
3500	NC_015576	GGCG	2	8	128378	128385	0 %	0 %	75 %	25 %	333988767

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